Instance Manager使用标准my.cnf文件。它使用[manager]部分为自己读取选项并读取[mysqld]部分来创建实例。[manager]部分包含上述列出的选项。下面为[manager]部分示例：

　　# MySQL Instance Manager options section

　　[manager]

　　default-mysqld-path = /usr/local/mysql/libexec/mysqld

　　socket=/tmp/manager.sock

　　pid-file=/tmp/manager.pid

　　password-file = /home/cps/.mysqlmanager.passwd

　　monitoring-interval = 2

　　port = 1999

　　bind-address = 192.168.1.5

　　MySQL实例管理器只在Unix中读取并管理/etc/my.cnf文件。在Windows中，MySQL实例管理器从Instance Manager的安装目录读取my.ini文件。用--defaults-file=file_ name选项可以更改默认选项文件的位置。

　　实例部分指定启动时给每个实例的选项。这些主要是普通MySQL服务器选项，但有一些IM-专用选项：

　　·mysqld-path =

　　mysqld服务器二进制的路径。

　　·shutdown-delay = Seconds

　　IM应等待实例关闭的秒数。 默认为35秒。超过延迟时间后，IM假定实例正挂起并试图“kill –9”它。如果你使用带large表的InnoDB，你应当增加该值。

　　·nonguarded

　　如果你想要为某个实例禁用IM监视功能，应设置该选项。

　　下面给出了几个实例示例。

　　[mysqld]

　　mysqld-path=/usr/local/mysql/libexec/mysqld

　　socket=/tmp/mysql.sock

　　port=3307

　　server_id=1

　　skip-stack-trace

　　core-file

　　skip-bdb

　　log-bin

　　log-error

　　log=mylog

　　log-slow-queries

　　[mysqld2]

　　nonguarded

　　port=3308

　　server_id=2

　　mysqld-path= /home/cps/mysql/trees/mysql-5.1/sql/mysqld

　　socket = /tmp/mysql.sock5

　　pid-file = /tmp/hostname.pid5

　　datadir= /home/cps/mysql_data/data_dir1

　　language=/home/cps/mysql/trees/mysql-5.1/sql/share/english

　　log-bin

　　log=/tmp/fordel.log